洁净室内的换气方式可分成两种方案：第一种是由空调过滤器直接换气，第二种是通过滤风机设备进行更换空气。

　　使用比较多的是空调过滤器换气，由进风空调器将空气送入洁净室，由排风风道将空气排出它能符合形状和面积的洁净室通风空调系统所提出的条件，保证换气平衡和压差，甚至在，大型综合性的不同洁净度的洁净工作台内也能做到这一点。因此，洁净室内循环的全部空气都经过空调器。这就要求增加进、排风风管的损耗。

　　简单的方案就是采用自控的耐高温过滤器通风机。由外部房间进入的空气经过过滤通风机进入洁净室，并通过排风风管将空气排出。经空调器昀空气仅进入外部房间。该方案适用于允许空气循环的场合，可以排出多余的热量和湿气，并利用室外空气送入外部房间，调节微气候参数的方式，符合卫生规范的要求。

　　通过过滤通风机送风能保证洁净室的灵活性。能够改变整个洁净室或个别洁净区的洁净度级别，可以重新改变洁净室的布置而费用不多。所示为柔性模块式洁净室。

　　这种洁净室的主要部件是吊顶设备。吊顶做成标准尺寸的方格。在方格内装有必要的模块：过滤通风、照明、排风和盲板等，低噪声的过滤通风模块起着关键的作用。

　　结构方案洁净室围护结构及其构件应保证符合洁净度的基本要求。

　　保证密闭性；不产生二次污染；不得有凸出部位，尖角、难以打扫的死角，凹处，缝隙等；具有光滑的表面；表面上不得有发亮斑点，应漆成悦目的颜色；必要时应将外部表面做出防静电和导电的；应坚固耐久；应有耐磨的表面；应防潮和不发霉；--应能经受清洗剂、消毒剂和其它物品的作用；应能保证便于使用和技术维修；--应能保证便于安装，必要时还要便于拆除和洁净室的重新布置。